Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBGCP5Q96RT8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBGCP5Q96RT8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms