Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CICQ96RK0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms