Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLIN4Q96Q06 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN4Q96Q06 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms