Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms