Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SORCS2Q96PQ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS2Q96PQ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms