Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP3Q96P47 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP3Q96P47 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms