Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms