Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC43Q96MW1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms