Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms