Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCMTD1Q96MG8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms