Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM227BQ96M60 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms