Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms