Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP8Q96LD8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms