Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms