Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms