Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HHIPL1Q96JK4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHIPL1Q96JK4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms