Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAX2Q96IS3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms