Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms