Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCMH1Q96GD3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCMH1Q96GD3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCMH1Q96GD3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCMH1Q96GD3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCMH1Q96GD3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCMH1Q96GD3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCMH1Q96GD3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCMH1Q96GD3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms