Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LTV1Q96GA3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms