Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms