Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPDL1Q96EA4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPDL1Q96EA4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms