Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTP4Q96DX8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms