Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4CQ96CF2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms