Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPTQ96BT3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms