Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD2Q96BF3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.3 ms