Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF34Q969K3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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