Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGP1Q92546 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms