Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113Q902F9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms