Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms