Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DCAF4Q8WV16 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms