Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGDCC4Q8TDY8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGDCC4Q8TDY8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms