Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM71BQ8TC56 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms