Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBA3Q8TBC4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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