Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATL2Q8NHH9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL2Q8NHH9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL2Q8NHH9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL2Q8NHH9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL2Q8NHH9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms