Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELBQ8NG08 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELBQ8NG08 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELBQ8NG08 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HELBQ8NG08 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELBQ8NG08 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELBQ8NG08 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELBQ8NG08 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELBQ8NG08 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELBQ8NG08 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HELBQ8NG08 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HELBQ8NG08 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HELBQ8NG08 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HELBQ8NG08 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELBQ8NG08 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELBQ8NG08 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELBQ8NG08 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELBQ8NG08 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELBQ8NG08 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELBQ8NG08 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms