Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms