Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APPL2Q8NEU8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APPL2Q8NEU8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms