Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms