Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms