Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT2Q8N9I0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms