Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC155Q8N6L0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC155Q8N6L0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms