Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SMIM20Q8N5G0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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SMIM20Q8N5G0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SMIM20Q8N5G0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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