Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A0

KRT222, Keratin-like protein KRT222, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT222Q8N1A0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT222Q8N1A0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT222Q8N1A0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms