Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms