Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACE1Q8IYU2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms