Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC170Q8IYT3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms