Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC105Q8IYK2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms