Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3BQ8IVW6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms