Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUD2

ERC1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERC1Q8IUD2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERC1Q8IUD2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERC1Q8IUD2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERC1Q8IUD2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERC1Q8IUD2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERC1Q8IUD2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ERC1Q8IUD2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERC1Q8IUD2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ERC1Q8IUD2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERC1Q8IUD2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERC1Q8IUD2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms